Les 40 équipes qualifiées sont tout d'abord triées par coefficient UEFA puis réparties dans 5 " pots " de 8 équipes.
POT N°1
POT N°2ClubsCoefficients AS Roma 73,191 VfB Stuttgart 58,166 AS Monaco FC 53,324Hertha Berlin 46,166 Lokomotiv Moscou38,469Besiktas37,872 AZ Alkmaar 37,145 FC Seville36,326
POT N°3ClubsCoefficientsOlympique de Marseille36,324 PAOK Salonique 35,715 Slavia Prague35,223 CSKA Moscou34,469 FC Bâle33,827Middlesbrough FC 32,864 Espanyol Barcelone29,326 RC Lens29,324
POT N°4ClubsCoefficientsShakhtar Donetsk28,200 Heerenveen26,145 Dniepropetrovsk24,200 Hambourg SV 24,166 Crvena Zvezda 21,012 Bolton Wanderers20,864 Sampdoria Gênes20,191 Palerme 20,191 ClubsCoefficientsSteaua Bucarest 20,101 Brøndby IF 19,676 Grasshopper Zurich18,887Zenit St Petersbourg 18,469 Levski Sofia 18,118 RC Strasbourg 17,324 Stade Rennais FC 16,324 CSKA Sofia15,118
POT N°5ClubsCoefficientsVitória Guimaraes 14,739 Litex Lovech 14,118 Halmstads13,076 Viking FK12,665 Dinamo Bucarest12,101 Rapid Bucarest 8,101 Maccabi Petach-Tikva 7,218 Tromso IL6,665
Le tirage au sort va ensuite permettre d'obtenir 8 groupes de 5 équipes. Chaque groupe sera donc composé :
- d'une équipe du pot N°1
- d'une équipe du pot N°2
- d'une équipe du pot N°3
- d'une équipe du pot N°4
- d'une équipe du pot N°5
Deux équipes d'un même pays/fédération ne peuvent pas être dans le même groupe.
Chaque équipe disputera deux matches à domicile et deux matches à l'extérieur.
A l'issue de ce second tour, les 3 premiers de chaque groupe se retrouvent au tour suivant : les 16èmes de finale.
Les 24 équipes sont rejoints par les huits clubs ayant terminé à la 3ème place des groupes de la Ligue des Champions.
Les 32 équipes qualifiées s'affrontent dans une confrontation à élimination directe sur deux matches (Domicile et Extérieur)
Le Calendrier de la Coupe UEFA :
second tour : Groupes
- Journée 1 : 20 octobre 2005
- Journée 2 : 3 novembre 2005
- Journée 3 : 24 novembre 2005
- Journée 4 : 30 novembre et 1er décembre 2005
- Journée 5 : 14 et 15 décembre 2005
16èmes de finale : Eliminiation directe
- 15 et 23 février 2006
8èmes de finale : Eliminiation directe
- 9 et 16 mars 2006
1/4 de finale : Eliminiation directe
- 30 mars et 6 avril 2006
1/2 finale : Eliminiation directe
- 20 et 27 avril 2006
Finale : 10 mai 2006